IBM teknologi membantu memerangi Virus flu

Sebuah obat antivirus baru untuk mengobati infeksi rhinovirus sedang dikembangkan oleh perusahaan Melbourne Biota Holdings Ltd, yang ditargetkan bagi mereka dengan kondisi yang ada di mana flu biasa adalah ancaman serius bagi kesehatan dan bisa berakibat fatal. Dalam hubungannya dengan para peneliti di IBM Research Collaboratory untuk Biologi-Melbourne, ilmuwan dari St Vincent Institut Riset Medis dan Universitas Melbourne menggunakan informasi tentang bagaimana obat baru bekerja untuk membuat simulasi 3D dari rhinovirus lengkap tentang superkomputer IBM teknologi. Untuk membantu membuka jalan untuk pengembangan obat baru, peneliti bekerja untuk membangun, sepenuhnya atomistik tiga dimensi simulasi HRV. Menurut IBM, perhitungan ini adalah yang pertama untuk tidak hanya mencakup 3 juta-plus atom dari rhinovirus kapsid-atau luar shell-dan lingkungan berair mereka, tetapi juga virus RNA genom, bahwa paket informasi genetik yang diperlukan untuk virus untuk ditiru. Sebuah obat antivirus baru untuk mengobati infeksi rhinovirus sedang dikembangkan oleh perusahaan Melbourne Biota Holdings Ltd, yang ditargetkan bagi mereka dengan kondisi di mana flu biasa adalah ancaman serius bagi kesehatan dan bisa berakibat fatal. Infeksi rhinovirus ini terkait dengan sekitar 70 persen dari semua eksaserbasi asma, dengan lebih dari 50 persen dari pasien yang memerlukan rawat inap. Selanjutnya, lebih dari 35 persen pasien dengan penyakit obstruktif akut kronis (PPOK) dirawat di rumah sakit setiap tahun karena virus pernapasan termasuk rhinovirus. Sebuah tim peneliti yang dipimpin oleh Profesor Michael Parker dari St Vincent Institute of Medical Research (SVI) dan University of Melbourne sekarang menggunakan informasi tentang bagaimana obat baru bekerja untuk membuat simulasi 3D dari rhinovirus lengkap dengan menggunakan superkomputer tercepat di Australia. "Pekerjaan kami baru-baru ini diterbitkan dengan Biota menunjukkan bahwa obat tersebut mengikat pada shell yang mengelilingi virus, yang disebut kapsid," kata Parker dalam sebuah pernyataan. "Tapi pekerjaan itu tidak menjelaskan secara terinci bagaimana obat dan pekerjaan lain yang sama akting senyawa." Profesor Parker dan timnya bekerja pada IBM Blue Gene baru diinstal / Q di Universitas Melbourne dengan ahli biologi komputasi dari IBM dan Hidup Victoria Ilmu Komputasi Initiative (VLSCI). Dalam produksi sejak 1 Juli 2012, IBM Blue Gene / Q adalah superkomputer paling kuat yang didedikasikan untuk penelitian ilmu kehidupan di belahan bumi Selatan dan saat ini menduduki peringkat tercepat di Australia. "IBM Blue Gene / P akan memberikan kita dengan luar biasa simulasi komputer 3D dari virus utuh dalam kerangka waktu yang bahkan tidak bermimpi sebelumnya," kata Parker. "Teknologi Supercomputer memungkinkan kita untuk mempelajari lebih dalam mekanisme yang bermain di dalam sel manusia, terutama bagaimana obat bekerja pada tingkat molekuler. "Pekerjaan ini menawarkan kesempatan yang menarik untuk mempercepat penemuan dan pengembangan pengobatan antivirus baru dan mudah-mudahan akan menyelamatkan banyak nyawa di seluruh dunia," katanya. Profesor Parker mengatakan bahwa upaya sebelumnya hanya mampu untuk fokus pada menjalankan simulasi lebih kecil di bagian hanya virus. Namun, Profesor James McCluskey, deputi wakil rektor untuk penelitian di University of Melbourne, mengatakan: "Bekerja pada rhinovirus adalah contoh bagaimana pendekatan baru untuk mengobati penyakit akan menjadi mungkin dengan kapasitas IBM Blue Gene Q, bagaimana kita berharap ini aset yang luar biasa akan dimanfaatkan oleh komunitas penelitian Victoria bekerja sama dengan IBM. "Ini adalah fasilitas yang luar biasa bagi para peneliti ilmu kehidupan Victoria, semakin memperkuat reputasi Victoria sebagai pusat bioteknologi terkemuka," katanya. John Wagner, Ph.D., manajer IBM Research Collaboratory untuk Biologi-Melbourne, co-terletak di VLSCI, mengatakan jenis simulasi adalah cara masa depan untuk penemuan obat. "Ini adalah cara kita melakukan biologi di abad 21," katanya. IBM baru operasional Blue Gene / Q diselenggarakan oleh University of Melbourne di VLSCI berada di peringkat 31 pada daftar TOP500 bergengsi global. Tabel TOP500 menominasikan yang 500 sistem komputer yang paling kuat di dunia. Para VLSCI merupakan inisiatif dari Pemerintah Victoria dalam kemitraan dengan Universitas Melbourne dan IBM Biologi Penelitian Collaboratory di Melbourne.